20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2318 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2318  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000141633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0520  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0529509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0508  TrkA domain-containing protein  29.77 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00495  hypothetical protein  31.53 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0703  TrkA-C domain protein  31.3 
 
 		 256 aa  96.7  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.308951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.61 
 
 		 330 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  29.47 
 
 		 330 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  29.79 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.11 
 
 		 411 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  31.68 
 
 		 337 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  29.79 
 
 		 334 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  29.79 
 
 		 334 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  29.79 
 
 		 330 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  29.79 
 
 		 330 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  28.79 
 
 		 279 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5523  potassium channel, putative  28.72 
 
 		 107 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  30.43 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  37.68 
 
 		 587 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12848  trkA domain protein  33.33 
 
 		 469 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 		 671 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>