36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0606 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0606  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0364  hypothetical protein  70.57 
 
 		 282 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1415  hypothetical protein  33.21 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  31.97 
 
 		 234 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11040  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.7 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2732  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.86 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.107407  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1188  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.9 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0634  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.24 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000476119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0647  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.53 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0278  radical SAM domain-containing protein  32.74 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0341  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.86 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0893  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.43 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0237925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0069  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.12 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1145  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.04 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.17989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2680  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.97 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549687  normal  0.538488 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0514  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.09 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18280  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.03 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1818  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3894  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.84 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2272  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like protein  32.2 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.487332  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1453  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.88 
 
 		 236 aa  52.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0238832  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1994  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.47 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.925403  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1058  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.25 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1856  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1192  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.43 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1600  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  23.76 
 
 		 228 aa  48.9  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3396  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0851  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.28 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1126  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.68 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0860  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.68 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2569  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.42 
 
 		 229 aa  45.8  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000247399  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2732  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.59 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0427  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.2 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1899  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.08 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000119044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1314  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0737076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0456  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.67 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>