29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0364 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0364  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0606  hypothetical protein  70.57 
 
 		 280 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1415  hypothetical protein  30.14 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1818  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11040  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.01 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  29.46 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2680  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.82 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549687  normal  0.538488 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0278  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0634  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  23.2 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000476119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0647  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.41 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0341  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.33 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18280  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.53 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1188  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.85 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0893  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.02 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0237925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2732  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.56 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.107407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0069  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  21.93 
 
 		 208 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0514  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.97 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3894  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.88 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1145  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.55 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.17989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3396  Radical SAM domain protein  34.21 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1899  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.17 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000119044  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1453  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.02 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0238832  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0860  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  22.61 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2272  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like protein  23.84 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.487332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1058  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.37 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1994  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.73 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.925403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  21.14 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1192  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.66 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1600  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.39 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>