22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0943 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0943  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
100 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000713443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  41.49 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  40.23 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  32.32 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  32.32 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0662  branched-chain amino acid transport  36.84 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00834286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  47.92 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  37.7 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  39.19 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1427  branched-chain amino acid transport  34.94 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0169671  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  40.82 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  45.45 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  27.91 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  31.46 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  31.46 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  29.03 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  38.3 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  41.18 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  30.77 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0649  branched-chain amino acid transport  36.17 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000140027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>