More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1857 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1857  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 134 aa  266  8e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  68.66 
 
 		 122 aa  179  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  65.67 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2701  50S ribosomal protein L14  66.42 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  67.91 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  66.42 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  66.42 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  66.42 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  66.42 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  172  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  65.67 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0701  50S ribosomal protein L14  67.16 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000715462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  65.67 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  67.91 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  66.42 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  67.16 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3002  50S ribosomal protein L14  65.67 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807584  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  67.91 
 
 		 122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  63.43 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  67.16 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0991  ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 120 aa  170  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2976  50S ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  169  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  68.46 
 
 		 119 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  65.67 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  68.46 
 
 		 119 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  64.93 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  65.67 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  65.67 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  65.67 
 
 		 122 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2569  50S ribosomal protein L14  66.42 
 
 		 122 aa  167  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  64.93 
 
 		 122 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  64.93 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  167  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  65.67 
 
 		 122 aa  167  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3169  50S ribosomal protein L14  61.94 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000025532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  61.94 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3307  50S ribosomal protein L14  61.94 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000545042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0877  50S ribosomal protein L14  61.94 
 
 		 122 aa  166  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0344551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  166  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  166  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  166  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  61.94 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  0.0000027231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000379152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172755  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  61.94 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  64.93 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000305715  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  61.94 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1936  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3713  50S ribosomal protein L14  64.93 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  64.93 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  66.15 
 
 		 119 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  61.94 
 
 		 122 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  61.94 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  60.45 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1624  50S ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118658  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  61.94 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  64.18 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  60.45 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  60.45 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  60.45 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  60.45 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  63.43 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  60.45 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  60.45 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  60.45 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  62.69 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>