21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3746 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3746  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
140 aa  284  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154235  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2954  acetyltransferase, GNAT family  36.36 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878787  hitchhiker  0.00000560426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2377  acetyltransferase, GNAT family  35.35 
 
 
308 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2167  acetyltransferase  36 
 
 
308 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  33 
 
 
308 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2510  acetyltransferase, GNAT family  33 
 
 
308 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115896  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2180  acetyltransferase  32 
 
 
308 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000230557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2224  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
308 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2247  acetyltransferase  32 
 
 
308 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0012519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2411  acetyltransferase  32 
 
 
308 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2429  acetyltransferase, gnat family  32 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.287092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2777  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.13799  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2312  pentapeptide protein  32.29 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0828621  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  25.26 
 
 
204 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  24.27 
 
 
311 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  28.7 
 
 
727 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  24.3 
 
 
442 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 
212 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  28.42 
 
 
233 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  28.42 
 
 
233 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  24.35 
 
 
320 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>