31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1200 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
267 aa  558  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244967  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0682  GCN5-related N-acetyltransferase  26.34 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.341989  normal  0.410017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0576  GCN5-related N-acetyltransferase  25.33 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0543356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0423  GCN5-related N-acetyltransferase  23.93 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  23.99 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1972  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2134  GCN5-related N-acetyltransferase  21.58 
 
 
267 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000159892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5909  GCN5-related N-acetyltransferase  26.89 
 
 
273 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05191  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3643  acetyltransferase, GNAT family  25.57 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1210  GCN5-related N-acetyltransferase  23.86 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.34789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2798  acetyltransferase  23.44 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.097578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2112  putative acetyltransferase  23.46 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2084  GCN5-related N-acetyltransferase  21.09 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3401  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217688  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0160  GCN5-related N-acetyltransferase  23.96 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9240  acetyltransferase protein  27.73 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2473  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
94 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1687  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2937  GCN5-related N-acetyltransferase  23.74 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1475  acetyltransferase  30.77 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6350  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06024  acetyltransferase  32.86 
 
 
141 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0369  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
256 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6068  GCN5-related N-acetyltransferase  24.11 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0245  acetyltransferase, GNAT family  26.15 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2623  acetyltransferase, GNAT family  28.75 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000303588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8386  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1655  acetyltransferase, GNAT family  23.66 
 
 
286 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2688  acetyltransferase, GNAT family  28.75 
 
 
266 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
146 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>