More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0236 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0236  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  100 
 
 
160 aa  327  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.857649  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1465  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  79.22 
 
 
157 aa  256  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0418975  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2667  pantetheine-phosphate adenylyltransferase (phosphopantetheine adenylyltransferase)  62 
 
 
150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.857504  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6230  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.08 
 
 
156 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.538241  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2616  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.86 
 
 
152 aa  155  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1371  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.89 
 
 
150 aa  143  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  44.37 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0369  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.31 
 
 
153 aa  138  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.61848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1466  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.76 
 
 
153 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  44.94 
 
 
162 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1613  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.72 
 
 
165 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07991  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.05 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0633  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.76 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0023  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.69 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0268  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.89 
 
 
162 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.526112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0298  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.22 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.72 
 
 
168 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1015  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.21 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1550  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.76 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0805117  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3756  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.22 
 
 
163 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1210  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.22 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561592  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1640  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.06 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000016077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4030  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.22 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0157676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0641  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.61 
 
 
173 aa  124  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.47 
 
 
159 aa  124  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2632  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.22 
 
 
163 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000126896  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1125  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.52 
 
 
166 aa  124  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000397383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3976  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.54 
 
 
163 aa  123  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3841  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.54 
 
 
163 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3671  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.54 
 
 
163 aa  123  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0440326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3688  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.54 
 
 
163 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.756476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4041  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.54 
 
 
163 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000581015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4139  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.54 
 
 
163 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3943  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.54 
 
 
163 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.47 
 
 
159 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  39.47 
 
 
159 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.47 
 
 
159 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.47 
 
 
159 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.47 
 
 
159 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  39.47 
 
 
159 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.47 
 
 
159 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.47 
 
 
159 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.47 
 
 
159 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1966  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
212 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.217223  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.47 
 
 
161 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.14 
 
 
159 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1605  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  41.33 
 
 
168 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.29131  normal  0.668561 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0788  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.26 
 
 
158 aa  121  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0482546  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0858  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.26 
 
 
158 aa  121  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.952002  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1245  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.26 
 
 
158 aa  121  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0694889  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4095  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.82 
 
 
159 aa  121  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.47 
 
 
159 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.5 
 
 
164 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.16 
 
 
159 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.16 
 
 
159 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.16 
 
 
159 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.16 
 
 
159 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4385  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.14 
 
 
163 aa  120  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1186  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.86 
 
 
170 aa  120  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1759  phosphopantetheine adenylyltransferase  36.6 
 
 
163 aa  120  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282683  normal  0.0728276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.1 
 
 
160 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.54 
 
 
170 aa  120  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2871  phosphopantetheine adenylyltransferase  37.65 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.658562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1000  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.5 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000348032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.45 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1113  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.86 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1371  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.76 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  40.13 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.13 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.69 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.71709  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1365  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.86 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.287294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1982  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.67 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1700  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.67 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.880065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0903  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.36 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.78 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0740  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.85 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2006  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  40.82 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4838  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.16 
 
 
161 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000302126  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1766  phosphopantetheine adenylyltransferase  35.8 
 
 
165 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66348  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  42.47 
 
 
170 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0188  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.96 
 
 
161 aa  118  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0127125  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1591  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.38 
 
 
162 aa  118  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000200475  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1629  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.16 
 
 
165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.435366  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.1 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2734  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.44 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.96 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3723  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.89 
 
 
164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.172497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2007  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.56 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.82 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1769  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.24 
 
 
164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0050342  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.82 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1192  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.65 
 
 
163 aa  117  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0142458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4369  phosphopantetheine adenylyltransferase  36.14 
 
 
164 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1243  phosphopantetheine adenylyltransferase  37.67 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.1 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2500  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.46 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2190  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.46 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000182101  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1282  coenzyme A biosynthesis protein  40.88 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0059  phosphopantetheine adenylyltransferase  36.18 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000113354  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2318  phosphopantetheine adenylyltransferase  36.55 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>