15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4010 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4010  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  508  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1941  putative terminase small subunit protein  45.27 
 
 
157 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138517  hitchhiker  0.0000797502 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2355  hypothetical protein  36.21 
 
 
147 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0853  putative terminase small subunit protein  37.01 
 
 
157 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0725  putative terminase small subunit protein  37.5 
 
 
156 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3755  hypothetical protein  36.22 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.928845  normal  0.0807852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  54.55 
 
 
338 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3005  putative phage associated protein  39.25 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1002  hypothetical protein  32.56 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1464  hypothetical protein  31.4 
 
 
190 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.489949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1153  hypothetical protein  42.42 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039121  hitchhiker  0.00000000000317402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2352  hypothetical protein  40.74 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2267  phage protein  30.77 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000190107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4082  hypothetical protein  51.22 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5069  hypothetical protein  51.22 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>