13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0856 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0856  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  207  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.90403e-25  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1831  transcriptional regulator, XRE family  70.53 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1942  XRE family transcriptional regulator  65.48 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859039  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2363  hypothetical protein  43.94 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000851565  hitchhiker  0.0000226429 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2341  hypothetical protein  55.32 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4438  hypothetical protein  46.3 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0609  hypothetical protein  44.44 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4276  hypothetical protein  44.44 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3899  regulatory protein RsaL  41.46 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45950  regulatory protein RsaL  45.71 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0304  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4790  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>