15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_R0046 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000202964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0056  tRNA-Ser  89.77 
 
 		 86 bp  87.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000000361768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0005  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0003  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0064  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454359  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2605  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0045  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0010  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0042  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30420  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0468  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60250  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>