30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3215 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3215  CRISPR-associated TM1812 family protein  100 
 
 		 416 aa  847    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1838  CRISPR-associated TM1812 family protein  28.8 
 
 		 429 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.929364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1192  CRISPR-associated protein with DxTHG motif  28.54 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15090  CRISPR-associated protein, TM1812 family  28.87 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0314  CRISPR-associated protein, TM1812 family  26.61 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000212664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1352  CRISPR-associated TM1812 family protein  29.14 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2057  CRISPR-associated TM1812 family protein  27.77 
 
 		 610 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3375  transposase IS3/IS911 family protein  26.38 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.905581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0730  CRISPR-associated TM1812 family protein  25.11 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0139732  normal  0.0941004 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2832  CRISPR-associated protein, TM1812 family  25.24 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3288  CRISPR-associated TM1812 family protein  28.22 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.392091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2981  CRISPR-associated protein, TM1812 family  24.69 
 
 		 551 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0731  CRISPR-associated TM1812 family protein  24.63 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0329491  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1064  CRISPR-associated protein, TM1812 family  23.17 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0265  CRISPR-associated Csx2 family protein  25.18 
 
 		 570 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1023  CRISPR-associated protein, TM1812 family  25.14 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000487995  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1954  CRISPR-associated protein, TM1812 family  21.01 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.530541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0959  CRISPR-associated TM1812 family protein  23.3 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1953  CRISPR-associated protein, TM1812 family  25.16 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1922  CRISPR-associated TM1812 family protein  28.14 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2299  CRISPR-associated protein DxTHG motif protein  21.41 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1246  CRISPR-associated TM1812 family protein  20 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2837  CRISPR-associated protein DxTHG motif protein  22.62 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.974478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0426  CRISPR-associated protein, TM1812 family  20.29 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0651  CRISPR-associated TM1812 family protein  28.28 
 
 		 583 aa  55.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0409281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1803  CRISPR-associated protein, TM1812 family  20.54 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1008  hypothetical protein  24.38 
 
 		 548 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0844912  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1098  hypothetical protein  24.38 
 
 		 548 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0288139  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1385  CRISPR-associated TM1812 family protein  25.77 
 
 		 543 aa  47.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0606  CRISPR-associated protein, TM1812 family  31.94 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>