15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1080 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1080  carbohydrate-binding family 25 protein  100 
 
 		 107 aa  226  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3163  carbohydrate-binding family 25 protein  42.06 
 
 		 163 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2169  carbohydrate-binding family 25 protein  44.33 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000539346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1937  carbohydrate-binding family 25 protein  45.16 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00703894  hitchhiker  0.000000196006 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0832  Carbohydrate binding family 25  44.33 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16020  Carbohydrate binding family 25  43.01 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2336  carbohydrate-binding family 25 protein  44.21 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1051  hypothetical protein  42.11 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1305  hypothetical protein  40.43 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3604  hypothetical protein  40.22 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3542  hypothetical protein  47.37 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0956  hypothetical protein  35.29 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0786  hypothetical protein  42.55 
 
 		 122 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1163  carbohydrate-binding family 25 protein  33.73 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00003822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1561  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  47.4  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>