48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1310 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  185  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1736  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2069  hypothetical protein  48.68 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0237975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2053  hypothetical protein  43.04 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0180454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24245  hypothetical protein  43.04 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0220477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2165  hypothetical protein  44.19 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0267267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18710  hypothetical protein  43.84 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00826862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2941  hypothetical protein  42.47 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0298735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1575  hypothetical protein  42.47 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3790  hypothetical protein  42.47 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.523446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1547  hypothetical protein  42.47 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1688  hypothetical protein  41.1 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3727  hypothetical protein  42.47 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1616  hypothetical protein  46.05 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.222857  hitchhiker  0.0000000071157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2015  hypothetical protein  42.47 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2198  hypothetical protein  39.13 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1464  hypothetical protein  46.67 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111169  hitchhiker  0.0000228701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1642  hypothetical protein  46.67 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000459021  hitchhiker  0.000578829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2001  hypothetical protein  42.59 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00375571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1862  hypothetical protein  42.59 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1855  hypothetical protein  42.59 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.187096  hitchhiker  0.0000143915 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1414  hypothetical protein  42.59 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.115884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2024  hypothetical protein  42.59 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1865  protein of unknown function DUF1315  40.74 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000580001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2726  hypothetical protein  41.94 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00110961  hitchhiker  0.000988908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2501  hypothetical protein  44.9 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000799763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2263  protein of unknown function DUF1315  40.32 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0336147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01734  hypothetical protein  44.9 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0645838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01746  hypothetical protein  44.9 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0320399  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1985  hypothetical protein  41.51 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1403  general negative regulator of transcription subunit 1  40.74 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.231053  normal  0.0314437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1419  general negative regulator of transcription subunit 1  40.74 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.3599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1386  general negative regulator of transcription subunit 1  40.74 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192473  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01263  hypothetical protein  38.71 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1883  general negative regulator of transcription subunit 1  40.74 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000481147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2064  negative transcription regulator subunit 1  40.74 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.576353  hitchhiker  0.00180561 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2349  hypothetical protein  41.51 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000171077  normal  0.0248494 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2094  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000821619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1971  protein of unknown function DUF1315  41.51 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.78632  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002911  putative cytoplasmic protein  35.19 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1852  hypothetical protein  33.96 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03046  hypothetical protein  35.19 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2213  protein of unknown function DUF1315  42.86 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1967  hypothetical protein  38.71 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1677  hypothetical protein  44.9 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1581  hypothetical protein  33.87 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2422  hypothetical protein  31.65 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2313  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>