12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4458 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4458  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  253  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542652  normal  0.0417353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2499  hypothetical protein  36.89 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4535  hypothetical protein  55.56 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6945  hypothetical protein  37.93 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06655  hypothetical protein  45.16 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0520  hypothetical protein  26.27 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.128365  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5005  hypothetical protein  31.36 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0516  hypothetical protein  47.62 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0096  hypothetical protein  29.03 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5561  hypothetical protein  27.43 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2240  hypothetical protein  62.96 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.41249  normal  0.593535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6094  hypothetical protein  29.69 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>