19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3752 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3752  negative regulator of genetic competence sporulation and motility-like protein  100 
 
 
261 aa  533  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000704019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2566  Negative regulator of genetic competence  27.03 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0085  negative regulator of genetic competence  25.86 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0564  negative regulator of genetic competence sporulation and motility-like protein  21.82 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1712  Negative regulator of genetic competence  24.32 
 
 
204 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3800  adaptor protein  38.64 
 
 
202 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000607064  hitchhiker  0.000000000000878856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1545  adaptor protein  38.64 
 
 
202 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00170142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1412  adaptor protein  38.64 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000280861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1400  adaptor protein  36.67 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1584  adaptor protein  36.67 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3725299999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1651  adaptor protein  36.67 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000117003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1510  adaptor protein  36.67 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000470165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1371  adaptor protein  36.67 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1372  adaptor protein  36.67 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000504302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1616  adaptor protein  36.67 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000116418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1213  adaptor protein  37.97 
 
 
200 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000472996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0444  adaptor protein  31.87 
 
 
196 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2184  adaptor protein  31.87 
 
 
196 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4102  Negative regulator of genetic competence  31.46 
 
 
193 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000186936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>