20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1466 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1466  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0980  5 nucleotidase, deoxy, cytosolic type C  75.13 
 
 
200 aa  315  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0281031  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1198  hypothetical protein  78.45 
 
 
192 aa  306  8e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1094  5 nucleotidase, deoxy, cytosolic type C  75.68 
 
 
197 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000018321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1228  hypothetical protein  75.41 
 
 
196 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3963  5 nucleotidase deoxy cytosolic type C  56.35 
 
 
212 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10780  hypothetical protein  24.62 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2918  hypothetical protein  27.27 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.439614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1396  hypothetical protein  25.79 
 
 
192 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.76309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3862  5 nucleotidase deoxy cytosolic type C  26.49 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.490075  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0921  5 nucleotidase deoxy cytosolic type C  26.88 
 
 
173 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4657  5 nucleotidase deoxy cytosolic type C  24.47 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00821968  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1905  5 nucleotidase deoxy cytosolic type C  24.04 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.278273  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3667  hypothetical protein  20.24 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.200803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0800  hypothetical protein  23.81 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3095  HAD superfamily hydrolase  24.35 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0454  5 nucleotidase deoxy cytosolic type C  24.46 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451871  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0947  phosphate acetyltransferase  25 
 
 
230 aa  42  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1355  5 nucleotidase deoxy cytosolic type C  20.56 
 
 
175 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.460561  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00390  conserved hypothetical protein  29.9 
 
 
297 aa  41.2  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>