20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2918 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2918  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  387  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.439614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1396  hypothetical protein  32.42 
 
 
192 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.76309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0171  hypothetical protein  32.39 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2400  hypothetical protein  33.52 
 
 
186 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0800  hypothetical protein  27.68 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10780  hypothetical protein  28.95 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2169  YqfW  32.68 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000311199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.08 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3667  hypothetical protein  25.93 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.200803 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1228  hypothetical protein  26.32 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1196  HAD superfamily phosphatase  23.81 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.203549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1466  hypothetical protein  27.66 
 
 
192 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1279  hypothetical protein  25.27 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.332906  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1094  5 nucleotidase, deoxy, cytosolic type C  26.94 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000018321  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0980  5 nucleotidase, deoxy, cytosolic type C  26.18 
 
 
200 aa  51.6  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0281031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0837  hypothetical protein  24.11 
 
 
171 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.676474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1198  hypothetical protein  25.25 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0347  hypothetical protein  24.86 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0257031  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3396  putative nucleotidase  21.81 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3963  5 nucleotidase deoxy cytosolic type C  23.94 
 
 
212 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>