14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1251 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1251  flavomodulin  100 
 
 		 363 aa  748    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1181  flavomodulin  48.36 
 
 		 370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.22666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4914  Thiol-activated cytolysin  24.14 
 
 		 512 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3327  anthrolysin O  24.14 
 
 		 506 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.692607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0011  anthrolysin O  24.24 
 
 		 512 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3109  thiol-activated cytolysin  23.82 
 
 		 512 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.777516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3355  thiol-activated cytolysin  23.82 
 
 		 512 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5230  perfringolysin O  23.2 
 
 		 512 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0156  perfringolysin O  24.77 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.772662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3327  anthrolysin O  23.51 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3096  perfringolysin O, thiol-activated cytolysin  23.44 
 
 		 512 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3314  thiol-activated cytolysin  23.51 
 
 		 512 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.436372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2999  perfringolysin O, thiol-activated cytolysin  23.51 
 
 		 512 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.468366  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0103  thiol-activated cytolysin  22.45 
 
 		 516 aa  47.4  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.258222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>