14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3109 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3314  thiol-activated cytolysin  96.29 
 
 
512 aa  1016    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.436372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3109  thiol-activated cytolysin  100 
 
 
512 aa  1052    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.777516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3096  perfringolysin O, thiol-activated cytolysin  95.31 
 
 
512 aa  1007    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2999  perfringolysin O, thiol-activated cytolysin  95.9 
 
 
512 aa  1014    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.468366  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3355  thiol-activated cytolysin  100 
 
 
512 aa  1052    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0156  perfringolysin O  68.73 
 
 
500 aa  728    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.772662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4914  Thiol-activated cytolysin  95.7 
 
 
512 aa  1009    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3327  anthrolysin O  94.65 
 
 
506 aa  986    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.692607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5230  perfringolysin O  95.51 
 
 
512 aa  1011    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0011  anthrolysin O  95.9 
 
 
512 aa  1011    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3327  anthrolysin O  99.02 
 
 
512 aa  1044    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0103  thiol-activated cytolysin  41.58 
 
 
516 aa  387  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.258222 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1251  flavomodulin  23.82 
 
 
363 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1181  flavomodulin  24.54 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.22666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>