13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0973 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0973  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  381  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0649  hypothetical protein  57.75 
 
 
187 aa  207  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.243103  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1293  hypothetical protein  44.39 
 
 
186 aa  154  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0051  hypothetical protein  38.22 
 
 
188 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.655941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4202  hypothetical protein  35.94 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4770  hypothetical protein  36.84 
 
 
188 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.556668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4769  hypothetical protein  34.57 
 
 
187 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0908146  normal  0.309715 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3446  hypothetical protein  34.78 
 
 
183 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0559181  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5334  hypothetical protein  33.15 
 
 
190 aa  88.6  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2193  hypothetical protein  42.71 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4374  hypothetical protein  40.21 
 
 
95 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000917536  normal  0.0162994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4204  hypothetical protein  38.14 
 
 
95 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1254  hypothetical protein  42.11 
 
 
58 aa  48.5  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>