12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0271 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000339936  hitchhiker  0.000000215213 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8555  CitB domain protein  28.12 
 
 		 398 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.388597  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  25.52 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  25.32 
 
 		 408 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2382  CitB domain protein  30.86 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  25.32 
 
 		 408 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1430  hypothetical protein  28.49 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  27.27 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1233  hypothetical protein  26.6 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.80526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5879  CitB domain-containing protein  25.61 
 
 		 404 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3814  CitB domain-containing protein  27.44 
 
 		 394 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>