11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1073 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1105  hypothetical protein  45.16 
 
 		 869 aa  758    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.889177  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1073  Cna B domain protein  100 
 
 		 910 aa  1875    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1498  hypothetical protein  44.59 
 
 		 902 aa  716    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1261  hypothetical protein  45.36 
 
 		 890 aa  764    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0478  hypothetical protein  37.02 
 
 		 876 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3164  Cna B-type  26.49 
 
 		 980 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592408  normal  0.0320112 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0516  hypothetical protein  22.58 
 
 		 972 aa  135  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2549  hypothetical protein  31.53 
 
 		 947 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  27.86 
 
 		 727 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.82 
 
 		 807 aa  45.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  24.82 
 
 		 814 aa  45.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>