More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0231 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0231  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  100 
 
 
341 aa  689    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0369  DNA polymerase III gamma and tau subunits  56.16 
 
 
341 aa  362  6e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000259471  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1210  Xaa-Pro peptidase  54.55 
 
 
345 aa  360  2e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.628716  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0365  Xaa-Pro peptidase  54.23 
 
 
341 aa  343  2e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.109948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0291  peptidase M24  51.34 
 
 
337 aa  342  8e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1506  Xaa-Pro peptidase  51.32 
 
 
340 aa  333  3e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  36.47 
 
 
354 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  33.24 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  34.85 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  34.24 
 
 
356 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  35.15 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  34.2 
 
 
364 aa  179  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1205  peptidase M24  36.12 
 
 
351 aa  178  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  34.59 
 
 
353 aa  176  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  33.02 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  32.36 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  32.84 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  32.17 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  32.74 
 
 
353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  34.01 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  32.14 
 
 
353 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  32.16 
 
 
348 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  33.13 
 
 
356 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0725  peptidase M24  31.55 
 
 
353 aa  172  9e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00261455  normal  0.742968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  33.13 
 
 
356 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  32.14 
 
 
353 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  32.54 
 
 
356 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  32.14 
 
 
353 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  32.54 
 
 
356 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  33.33 
 
 
354 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  31.38 
 
 
353 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  31.67 
 
 
353 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  32.54 
 
 
356 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  32.26 
 
 
353 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  31.67 
 
 
353 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  31.67 
 
 
353 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  31.38 
 
 
353 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  33.43 
 
 
356 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  31.96 
 
 
353 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  33.72 
 
 
362 aa  169  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  33.13 
 
 
356 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  30.99 
 
 
357 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  32.43 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  33.43 
 
 
359 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  32.84 
 
 
356 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  31.99 
 
 
356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  32.15 
 
 
356 aa  165  8e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  33.85 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  31.94 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  31.63 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  31.78 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  33.44 
 
 
353 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  33.44 
 
 
353 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  34.98 
 
 
364 aa  162  9e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0624  peptidase/creatianse family protein  31.94 
 
 
357 aa  161  1e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  31.76 
 
 
353 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1740  aminopeptidase P  33.05 
 
 
366 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  31.16 
 
 
365 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  31.16 
 
 
365 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  29.57 
 
 
359 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  31.9 
 
 
362 aa  160  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  31.16 
 
 
365 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  31.16 
 
 
365 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  31.16 
 
 
365 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  31.16 
 
 
365 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  34.98 
 
 
369 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0732  peptidase M24  34.06 
 
 
351 aa  160  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000296906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1338  peptidase M24  37.69 
 
 
352 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0496679  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  30.26 
 
 
359 aa  159  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  31.16 
 
 
365 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  33.04 
 
 
346 aa  159  5e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  31.04 
 
 
359 aa  159  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  31.16 
 
 
365 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  33.93 
 
 
354 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  31.16 
 
 
365 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  31.16 
 
 
365 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  33.04 
 
 
352 aa  158  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  31.2 
 
 
357 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  34.2 
 
 
361 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  32.92 
 
 
357 aa  156  4e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  40.68 
 
 
354 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  30.75 
 
 
353 aa  156  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0710  peptidase M24  33.43 
 
 
364 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  31.34 
 
 
358 aa  155  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  30.59 
 
 
365 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  31.41 
 
 
347 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  37.18 
 
 
357 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  29.29 
 
 
361 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  38.03 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  39.91 
 
 
351 aa  152  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  28.99 
 
 
361 aa  152  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1724  peptidase M24  32.14 
 
 
354 aa  151  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  35.9 
 
 
361 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  33.33 
 
 
359 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  37.66 
 
 
371 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  35.9 
 
 
361 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  31.04 
 
 
363 aa  150  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  29.63 
 
 
381 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0585  peptidase M24  33.53 
 
 
364 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  35.47 
 
 
361 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>