17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1451 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1451  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  285  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.032173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1377  hypothetical protein  67.12 
 
 
147 aa  203  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000058538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1958  hypothetical protein  54.11 
 
 
150 aa  168  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000375951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2113  hypothetical protein  49.64 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2312  hypothetical protein  47.59 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1164  hypothetical protein  46.9 
 
 
148 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.206203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1668  hypothetical protein  45.07 
 
 
145 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1404  hypothetical protein  45.07 
 
 
145 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.600652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3604  hypothetical protein  41.43 
 
 
146 aa  131  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000100109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3377  hypothetical protein  46.81 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.48932e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2536  hypothetical protein  43.17 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0913  hypothetical protein  40.14 
 
 
147 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1207  hypothetical protein  33.82 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00284372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1733  hypothetical protein  27.14 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1700  hypothetical protein  27.14 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  36.67 
 
 
403 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  37.14 
 
 
428 aa  40.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>