15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1404 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1404  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  291  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.600652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1668  hypothetical protein  99.31 
 
 
145 aa  289  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1377  hypothetical protein  46.76 
 
 
147 aa  137  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000058538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1451  hypothetical protein  45.07 
 
 
146 aa  134  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.032173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1958  hypothetical protein  46.76 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000375951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2312  hypothetical protein  39.44 
 
 
146 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2113  hypothetical protein  38.85 
 
 
159 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1164  hypothetical protein  37.59 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.206203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3604  hypothetical protein  39.57 
 
 
146 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000100109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3377  hypothetical protein  36.88 
 
 
150 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.48932e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2536  hypothetical protein  35.92 
 
 
147 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0913  hypothetical protein  36.62 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1207  hypothetical protein  31.65 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00284372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1700  hypothetical protein  29.5 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1733  hypothetical protein  29.5 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>