17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1958 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1958  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  292  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000375951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1377  hypothetical protein  56.46 
 
 
147 aa  178  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000058538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1451  hypothetical protein  54.11 
 
 
146 aa  168  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.032173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1164  hypothetical protein  48.98 
 
 
148 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.206203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3604  hypothetical protein  52.08 
 
 
146 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000100109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3377  hypothetical protein  50.34 
 
 
150 aa  154  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.48932e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2312  hypothetical protein  50.34 
 
 
146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2113  hypothetical protein  49.32 
 
 
159 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2536  hypothetical protein  43.15 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1668  hypothetical protein  46.76 
 
 
145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1404  hypothetical protein  46.76 
 
 
145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.600652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0913  hypothetical protein  41.96 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1733  hypothetical protein  36.43 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1700  hypothetical protein  36.43 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110308  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1207  hypothetical protein  33.79 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00284372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  31.43 
 
 
403 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  43.24 
 
 
404 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>