16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1377 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1377  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  294  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000058538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1451  hypothetical protein  67.12 
 
 
146 aa  203  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.032173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1958  hypothetical protein  56.46 
 
 
150 aa  178  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000375951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2113  hypothetical protein  50.7 
 
 
159 aa  153  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1164  hypothetical protein  46.38 
 
 
148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.206203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3604  hypothetical protein  45.52 
 
 
146 aa  141  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000100109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1668  hypothetical protein  46.76 
 
 
145 aa  137  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1404  hypothetical protein  46.76 
 
 
145 aa  137  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.600652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3377  hypothetical protein  44.29 
 
 
150 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.48932e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2312  hypothetical protein  42.47 
 
 
146 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2536  hypothetical protein  41.43 
 
 
147 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0913  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1207  hypothetical protein  28.28 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00284372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1700  hypothetical protein  26.9 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1733  hypothetical protein  26.9 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  36.23 
 
 
403 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>