30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2840 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2840  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  137  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0109856  normal  0.0353192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0218  hypothetical protein  59.09 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0344  hypothetical protein  51.11 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.764143  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3864  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2236  hypothetical protein  54.76 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6392  hypothetical protein  40.74 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.109698  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3455  hypothetical protein  42 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2130  hypothetical protein  52.27 
 
 
65 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439751  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01582  hypothetical protein  51.16 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3656  hypothetical protein  42.86 
 
 
60 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04454  hypothetical protein  48.89 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1262  hypothetical protein  48.89 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2873  hypothetical protein  51.16 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2126  hypothetical protein  47.83 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.669451 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0056  hypothetical protein  48.78 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0785  hypothetical protein  44.44 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2917  hypothetical protein  42.22 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.720765  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1105  hypothetical protein  46.67 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958789  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2422  hypothetical protein  43.48 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3447  hypothetical protein  45.76 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0386  hypothetical protein  37.93 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00058247  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3196  hypothetical protein  62.79 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.848761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0105  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1975  hypothetical protein  51.16 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1881  hypothetical protein  33.9 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4354  hypothetical protein  48.89 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157382  normal  0.541932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3487  hypothetical protein  49.02 
 
 
65 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1438  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.254968  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1901  hypothetical protein  48.84 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0782  hypothetical protein  52.08 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>