43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4354 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4354  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  201  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157382  normal  0.541932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1923  hypothetical protein  87.3 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0105  hypothetical protein  65.82 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1210  hypothetical protein  70.31 
 
 		 87 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1438  hypothetical protein  69.35 
 
 		 76 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.254968  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3447  hypothetical protein  71.67 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1901  hypothetical protein  74.51 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2249  hypothetical protein  69.09 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584224  normal  0.945826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1299  hypothetical protein  73.47 
 
 		 55 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1975  hypothetical protein  66.67 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0782  hypothetical protein  68.09 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3487  hypothetical protein  65.31 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0344  hypothetical protein  58.33 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.764143  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3864  hypothetical protein  55 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2917  hypothetical protein  54.35 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.720765  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2126  hypothetical protein  48.65 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.669451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0386  hypothetical protein  54.17 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00058247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0785  hypothetical protein  41.79 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1105  hypothetical protein  59.18 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0056  hypothetical protein  55.1 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1881  hypothetical protein  44.68 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3455  hypothetical protein  55.1 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04454  hypothetical protein  57.14 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1262  hypothetical protein  54.17 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2422  hypothetical protein  53.19 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01582  hypothetical protein  55.32 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1362  hypothetical protein  41.82 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.62908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2873  hypothetical protein  58.97 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4974  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0287  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0300  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0281  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0373  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0329  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0332  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0346  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0281  hypothetical protein  50 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2236  hypothetical protein  48.72 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113885 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0218  hypothetical protein  51.16 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2840  hypothetical protein  48.89 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0109856  normal  0.0353192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6392  hypothetical protein  37.29 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.109698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3656  hypothetical protein  37.04 
 
 		 60 aa  42  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2130  hypothetical protein  47.83 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>