42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2130 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2130  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439751  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0218  hypothetical protein  68.75 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3196  hypothetical protein  67.8 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.848761  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01582  hypothetical protein  56.52 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0344  hypothetical protein  58.7 
 
 
69 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.764143  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2126  hypothetical protein  50.82 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.669451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0386  hypothetical protein  56.52 
 
 
63 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00058247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1262  hypothetical protein  45.61 
 
 
59 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3864  hypothetical protein  53.23 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0056  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2422  hypothetical protein  56.52 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1975  hypothetical protein  60.47 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2917  hypothetical protein  45.65 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.720765  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2840  hypothetical protein  52.27 
 
 
72 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0109856  normal  0.0353192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2873  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0785  hypothetical protein  47.73 
 
 
77 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3455  hypothetical protein  47.83 
 
 
66 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1105  hypothetical protein  50 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958789  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3487  hypothetical protein  52.17 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1210  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0373  hypothetical protein  55 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0329  hypothetical protein  55 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0287  hypothetical protein  55 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0300  hypothetical protein  55 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0281  hypothetical protein  55 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1881  hypothetical protein  38.98 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04454  hypothetical protein  47.83 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0332  hypothetical protein  55 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4974  hypothetical protein  55 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0346  hypothetical protein  55 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0105  hypothetical protein  54.35 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0281  hypothetical protein  55 
 
 
52 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0782  hypothetical protein  44.62 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2249  hypothetical protein  54.76 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584224  normal  0.945826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1923  hypothetical protein  45.9 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3447  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1901  hypothetical protein  51.16 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138834  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1438  hypothetical protein  42.37 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.254968  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2236  hypothetical protein  47.62 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4354  hypothetical protein  47.83 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157382  normal  0.541932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3656  hypothetical protein  42.22 
 
 
60 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105429 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0210  hypothetical protein  41.86 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>