20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5785 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5785  Muconolactone delta-isomerase  100 
 
 		 200 aa  393  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10321  muconolactone isomerase  54.95 
 
 		 204 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662536  normal  0.852606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38380  muconolactone delta-isomerase  39.56 
 
 		 94 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2367  Muconolactone delta-isomerase  34.44 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0232225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3041  muconolactone Delta-isomerase  31.11 
 
 		 92 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.661206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1932  muconolactone delta-isomerase  35.53 
 
 		 92 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.414838  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4677  muconolactone delta-isomerase  28.26 
 
 		 94 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0629639  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1121  muconolactone Delta-isomerase  32.89 
 
 		 91 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2374  muconolactone delta-isomerase  30.34 
 
 		 92 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1587  muconolactone delta-isomerase  32.22 
 
 		 100 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0277807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4877  muconolactone delta-isomerase  32.89 
 
 		 92 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.674817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0141  muconolactone delta-isomerase  28.95 
 
 		 98 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0159  muconolactone delta-isomerase  28.95 
 
 		 98 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2118  muconolactone delta-isomerase  26.67 
 
 		 92 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1269  muconolactone delta-isomerase  28.09 
 
 		 96 aa  44.7  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.477839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0837  muconolactone delta-isomerase  28.57 
 
 		 95 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0331  muconolactone delta-isomerase  28.95 
 
 		 94 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1330  muconolactone delta-isomerase  28.09 
 
 		 92 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.223053  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19210  muconolactone delta-isomerase  27.78 
 
 		 95 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277055  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1690  muconolactone delta-isomerase  28.95 
 
 		 92 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>