38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10321 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10321  muconolactone isomerase  100 
 
 		 204 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662536  normal  0.852606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5785  Muconolactone delta-isomerase  54.95 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38380  muconolactone delta-isomerase  45.16 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2118  muconolactone delta-isomerase  39.13 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0159  muconolactone delta-isomerase  35.58 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4877  muconolactone delta-isomerase  38.04 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.674817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2367  Muconolactone delta-isomerase  41.76 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0232225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1502  muconolactone delta-isomerase  36.96 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165868  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0141  muconolactone delta-isomerase  34.69 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1426  muconolactone delta-isomerase  36.96 
 
 		 96 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1362  muconolactone delta-isomerase  36.96 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12038  normal  0.0794783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1869  muconolactone delta-isomerase  34.78 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4155  muconolactone delta-isomerase  36.56 
 
 		 94 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1932  muconolactone delta-isomerase  35.87 
 
 		 92 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.414838  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1587  muconolactone delta-isomerase  36.96 
 
 		 100 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0277807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3236  muconolactone delta-isomerase  35.87 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.353793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1690  muconolactone delta-isomerase  33.7 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0331  muconolactone delta-isomerase  31.52 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1269  muconolactone delta-isomerase  33.7 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.477839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3041  muconolactone Delta-isomerase  30.43 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.661206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1121  muconolactone Delta-isomerase  32.61 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3938  muconolactone delta-isomerase  29.9 
 
 		 94 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358097  normal  0.0505497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2374  muconolactone delta-isomerase  32.61 
 
 		 92 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1411  muconolactone delta-isomerase  34.41 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.923457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6301  muconolactone delta-isomerase  33.7 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.734539  hitchhiker  0.00919301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1395  muconolactone delta-isomerase  34.41 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0837  muconolactone delta-isomerase  32.29 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6586  muconolactone delta-isomerase  33.7 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.859863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1377  muconolactone delta-isomerase  34.41 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1175  muconolactone delta-isomerase  32.61 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.986805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4677  muconolactone delta-isomerase  33.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0629639  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19210  muconolactone delta-isomerase  33.67 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277055  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1359  muconolactone Delta-isomerase  33.33 
 
 		 94 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24655  normal  0.135289 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3829  muconolactone delta-isomerase  33.7 
 
 		 96 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0976  muconolactone Delta-isomerase  31.52 
 
 		 96 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1330  muconolactone delta-isomerase  30.43 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.223053  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1293  muconolactone delta-isomerase  34.07 
 
 		 113 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2330  muconolactone delta-isomerase  28.26 
 
 		 96 aa  41.2  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>