10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4445 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4445    100 
 
 		 129 bp  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5727  histidine kinase  83.33 
 
 		 456 bp  63.9  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.21896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3645    83.7 
 
 		 309 bp  63.9  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5281  histidine kinase  83.33 
 
 		 456 bp  63.9  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263883  normal  0.386303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  94.87 
 
 		 990 bp  61.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  94.87 
 
 		 990 bp  61.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  94.87 
 
 		 990 bp  61.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    87.5 
 
 		 3818 bp  56  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  92.31 
 
 		 990 bp  54  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  85.71 
 
 		 957 bp  48.1  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>