13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0993 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0993  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  241  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  decreased coverage  0.000956488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8173  hypothetical protein  55.66 
 
 
143 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13663  hypothetical protein  41.33 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.021051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3898  hypothetical protein  40.95 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08590  hypothetical protein  36.52 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2593  hypothetical protein  35.4 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0601  hypothetical protein  38.68 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0758  hypothetical protein  38.36 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0960  hypothetical protein  29.41 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.755173  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1340  hypothetical protein  29.33 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1013  hypothetical protein  28.99 
 
 
120 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0649391  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0932  hypothetical protein  28.99 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20910  hypothetical protein  32.71 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>