14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3898 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3898  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  232  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08590  hypothetical protein  54.81 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2593  hypothetical protein  48.78 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8173  hypothetical protein  44.04 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20910  hypothetical protein  47.97 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0993  hypothetical protein  37.9 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  decreased coverage  0.000956488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13663  hypothetical protein  47.89 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.021051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0758  hypothetical protein  38.27 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1749  hypothetical protein  30.77 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.336545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1013  hypothetical protein  29.46 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0649391  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0932  hypothetical protein  28.85 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0601  hypothetical protein  36.94 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1340  hypothetical protein  23.17 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0960  hypothetical protein  25.61 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.755173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>