11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0758 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0758  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8173  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13663  hypothetical protein  36.14 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.021051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3898  hypothetical protein  39.71 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0601  hypothetical protein  33.04 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0993  hypothetical protein  38.36 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  decreased coverage  0.000956488 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20910  hypothetical protein  33.04 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08590  hypothetical protein  35.37 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1749  hypothetical protein  27.59 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.336545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1013  hypothetical protein  29.13 
 
 		 120 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0649391  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2593  hypothetical protein  37.8 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>