13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08590 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08590  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  237  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2593  hypothetical protein  55.66 
 
 
127 aa  110  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3898  hypothetical protein  55.34 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8173  hypothetical protein  40.19 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20910  hypothetical protein  45.87 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0993  hypothetical protein  36.52 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  decreased coverage  0.000956488 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1013  hypothetical protein  26.72 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0649391  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1749  hypothetical protein  32.91 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.336545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0932  hypothetical protein  25.49 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1340  hypothetical protein  30.67 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13663  hypothetical protein  35.24 
 
 
114 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.021051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0758  hypothetical protein  27.1 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0960  hypothetical protein  29.33 
 
 
117 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.755173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>