28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2147 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2147  putative sporulation protein YtxC  100 
 
 
292 aa  564  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.155216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1859  putative sporulation protein YtxC  91.44 
 
 
292 aa  520  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000476636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2071  hypothetical protein  35.06 
 
 
307 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2059  hypothetical protein  33.92 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3340  sporulation protein YtxC  34.39 
 
 
305 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.361684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1610  hypothetical protein  37.27 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05550  Sporulation protein YtxC  32.76 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000254786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2403  sporulation protein YtxC  29.92 
 
 
298 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.487377  normal  0.341648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1761  hypothetical protein  27.27 
 
 
288 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135656  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1765  Sporulation protein YtxC  31.7 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0184  Sporulation protein YtxC  27.78 
 
 
291 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1087  hypothetical protein  36.31 
 
 
309 aa  89.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.191663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1386  hypothetical protein  24.14 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0109943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1826  hypothetical protein  29.82 
 
 
269 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000412043  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2662  sporulation protein YtxC  23.87 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0490849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4408  sporulation protein YtxC  25.96 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3263  hypothetical protein  24.26 
 
 
283 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0355172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4686  hypothetical protein  25.53 
 
 
293 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000032151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0551  hypothetical protein  25.53 
 
 
293 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00074559  unclonable  3.78376e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4692  hypothetical protein  25.71 
 
 
293 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.6655100000000002e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4708  hypothetical protein  26.43 
 
 
281 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00398363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4473  hypothetical protein  25.35 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4702  hypothetical protein  26.43 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000701759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4821  hypothetical protein  25.35 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00789163  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4319  hypothetical protein  25.71 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4308  hypothetical protein  25.71 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0157841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0796  sporulation protein YtxC  20.99 
 
 
291 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2176  hypothetical protein  23.91 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>