29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3340 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3340  sporulation protein YtxC  100 
 
 
305 aa  609  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.361684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2071  hypothetical protein  55.78 
 
 
307 aa  350  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1610  hypothetical protein  39.27 
 
 
297 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2403  sporulation protein YtxC  34.68 
 
 
298 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.487377  normal  0.341648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2059  hypothetical protein  35.27 
 
 
292 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1761  hypothetical protein  32.23 
 
 
288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135656  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05550  Sporulation protein YtxC  32.05 
 
 
282 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000254786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1087  hypothetical protein  27.36 
 
 
309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.191663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1859  putative sporulation protein YtxC  32.87 
 
 
292 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000476636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1765  Sporulation protein YtxC  30.79 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0184  Sporulation protein YtxC  29.57 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2147  putative sporulation protein YtxC  34.39 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.155216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1386  hypothetical protein  29.02 
 
 
277 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0109943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2662  sporulation protein YtxC  24.44 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0490849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2176  hypothetical protein  26.47 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3263  hypothetical protein  23.88 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0355172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1826  hypothetical protein  23.61 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000412043  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4408  sporulation protein YtxC  23.23 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4708  hypothetical protein  24.04 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00398363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4702  hypothetical protein  24.04 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000701759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4319  hypothetical protein  24.04 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4308  hypothetical protein  24.04 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0157841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4692  hypothetical protein  24.04 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.6655100000000002e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4686  hypothetical protein  22.73 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000032151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4473  hypothetical protein  24.04 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0551  hypothetical protein  22.73 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00074559  unclonable  3.78376e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4821  hypothetical protein  24.04 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00789163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0796  sporulation protein YtxC  18.41 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0168  hypothetical protein  25.5 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>