26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0299 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0299  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  838    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0294  hypothetical protein  96.95 
 
 		 426 aa  754    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.249344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2192  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.56 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0101664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1050  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.19 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3069  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.68 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0288  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.83 
 
 		 415 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3962  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.22 
 
 		 423 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000202017  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1797  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.44 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0249  hypothetical protein  27.01 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00739776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4975  hypothetical protein  25.28 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5286  hypothetical protein  24.86 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5031  hypothetical protein  24.86 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.322167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5269  hypothetical protein  24.86 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5344  hypothetical protein  24.58 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5412  hypothetical protein  24.86 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4861  hypothetical protein  24.86 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5299  hypothetical protein  24.86 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4876  hypothetical protein  24.58 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.744899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5657  hypothetical protein  25.42 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3720  hypothetical protein  24.3 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2994  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.7 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000815912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3177  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.87 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  32.53 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  32.53 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  26.98 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>