25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0294 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0299  hypothetical protein  96.95 
 
 
426 aa  754    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0294  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  835    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.249344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2192  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.74 
 
 
439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0101664  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1050  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.65 
 
 
414 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3069  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.08 
 
 
415 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0288  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.71 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3962  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.31 
 
 
423 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000202017  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1797  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.28 
 
 
423 aa  93.2  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0249  hypothetical protein  26.62 
 
 
405 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00739776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4975  hypothetical protein  24.51 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5286  hypothetical protein  24.58 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5412  hypothetical protein  24.58 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5269  hypothetical protein  24.58 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5344  hypothetical protein  24.29 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5031  hypothetical protein  24.58 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.322167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4861  hypothetical protein  24.58 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5299  hypothetical protein  24.58 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4876  hypothetical protein  24.29 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.744899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5657  hypothetical protein  24.58 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3720  hypothetical protein  24.02 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2994  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.14 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000815912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3177  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.26 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  32.53 
 
 
408 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  33.33 
 
 
391 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  32.53 
 
 
408 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>