40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0249 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0249  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  803    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00739776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3069  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.82 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576298  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1050  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.27 
 
 		 414 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000225912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3962  PDZ/DHR/GLGF domain protein  45.5 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000202017  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2192  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.45 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0101664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0288  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.64 
 
 		 415 aa  229  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1797  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.31 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0299  hypothetical protein  25.89 
 
 		 426 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0294  hypothetical protein  24.7 
 
 		 426 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.249344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2994  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.4 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000815912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3177  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.4 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3720  hypothetical protein  24.72 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4975  hypothetical protein  23.24 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4876  hypothetical protein  23.5 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.744899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5299  hypothetical protein  23.24 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5344  hypothetical protein  23.5 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4861  hypothetical protein  23.5 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5031  hypothetical protein  23.5 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.322167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5657  hypothetical protein  23.77 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5412  hypothetical protein  23.5 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5269  hypothetical protein  23.5 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5286  hypothetical protein  22.72 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  43.48 
 
 		 485 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  23.65 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  35.44 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  40 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  40 
 
 		 497 aa  46.6  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  34.83 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.49 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  34.92 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  30.91 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  27.27 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  31.4 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  28.57 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  33.8 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.4 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  30 
 
 		 468 aa  43.5  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0864  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.38 
 
 		 291 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  30.56 
 
 		 455 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3096  serine endoprotease  34.67 
 
 		 485 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>