12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04860 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE04860  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  938    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04870  proline dehydrogenase, putative  61.37 
 
 		 603 aa  485  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09277  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_1155  predicted protein  21.88 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.912314  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13232  predicted protein  24.23 
 
 		 505 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.827246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4393  Proline dehydrogenase  34.41 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00224324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1516  Proline dehydrogenase  21.07 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954535  normal  0.684859 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10548  CpmD protein involved in carbapenem biosynthesis  28.57 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5730  Proline dehydrogenase  37.5 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0861839 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2181  Proline dehydrogenase  34.43 
 
 		 393 aa  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2814  proline dehydrogenase  26.04 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.253069  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0720  proline dehydrogenase  26.88 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>