34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND05520 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND05520  transcription factor, putative  100 
 
 
925 aa  1902    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.21086  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06715  MBPA protein Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C464]  28.81 
 
 
888 aa  144  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0498287  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00820  transcription factor, putative  58.82 
 
 
754 aa  141  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.140572  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03154  putative APSES transcription factor (Eurofung)  61.62 
 
 
695 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.343763  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34547  predicted protein  55.88 
 
 
793 aa  132  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.409576  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75432  transcription factor involved in cell cycle dependent gene expression  24.92 
 
 
711 aa  115  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0761994  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65402  predicted protein  60.29 
 
 
854 aa  97.8  7e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.609736  normal  0.732971 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05836  Cell pattern formation-associated protein stuA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P36011]  27.78 
 
 
622 aa  58.9  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.632834 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  27.81 
 
 
4520 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32309  basic helix-loop-helix transcription factor  29.63 
 
 
385 aa  55.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  27.66 
 
 
450 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  27.27 
 
 
1005 aa  50.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  30.81 
 
 
395 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  24.88 
 
 
2171 aa  50.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  26.92 
 
 
305 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  26.94 
 
 
891 aa  50.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  25.98 
 
 
2413 aa  48.9  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  27.23 
 
 
646 aa  48.5  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09003  conserved hypothetical protein  50 
 
 
1387 aa  48.5  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  27.18 
 
 
750 aa  48.1  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  47.06 
 
 
479 aa  48.1  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67427  predicted protein  26.74 
 
 
501 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0564378  normal  0.625866 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  26.94 
 
 
483 aa  46.6  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  28.41 
 
 
404 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  47.92 
 
 
278 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  24.88 
 
 
249 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  43.14 
 
 
382 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1452  predicted protein  26.29 
 
 
493 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0338335  normal  0.137357 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  27.13 
 
 
954 aa  45.8  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  28.73 
 
 
1585 aa  45.8  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  29.76 
 
 
1061 aa  45.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  47.83 
 
 
490 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0474  Ankyrin  27.17 
 
 
868 aa  44.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  26.14 
 
 
723 aa  44.3  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>