14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06080 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC06080  nucleus protein, putative  100 
 
 
609 aa  1241    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03937  CwfJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08250)  31.34 
 
 
563 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0307545  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34185  predicted protein  27.15 
 
 
462 aa  110  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0853114  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57770  predicted protein  29.96 
 
 
512 aa  101  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49146  predicted protein  30.27 
 
 
856 aa  97.8  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38158  predicted protein  29.31 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.455149  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04780  conserved hypothetical protein  23.32 
 
 
892 aa  54.3  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835456  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  30.77 
 
 
1060 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4660  histidine triad (HIT) protein  29.06 
 
 
160 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.374952  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05020  hypothetical protein  35.53 
 
 
1641 aa  47.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00970662  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8500  predicted protein  32 
 
 
153 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.768552  decreased coverage  0.000480268 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44192  predicted protein  40.82 
 
 
267 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0620048  decreased coverage  0.00852794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  29.23 
 
 
250 aa  45.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  28.45 
 
 
169 aa  45.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>