17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09071 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09071  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  201  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0103  hypothetical protein  42.71 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1960  hypothetical protein  41.05 
 
 
93 aa  77  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.779508  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  28.41 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  30.34 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  25 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  23.6 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  25.81 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  20.65 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  26.6 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  22.22 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  22.47 
 
 
99 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  23.86 
 
 
90 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  25.81 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  29.27 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>