15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1960 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  187  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.779508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0103  hypothetical protein  44.68 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09071  hypothetical protein  41.05 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  25.81 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  22.73 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  24.74 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  25.84 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  27.59 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  25.84 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  24.42 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  21.51 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  19.32 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  26.44 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>