20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0296 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0296  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0103  hypothetical protein  74.47 
 
 
305 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0578283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3091  hypothetical protein  74.47 
 
 
284 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1660  hypothetical protein  74.47 
 
 
284 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3459  hypothetical protein  74.47 
 
 
284 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69279  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2884  hypothetical protein  74.91 
 
 
279 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3963  hypothetical protein  74.69 
 
 
245 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3881  hypothetical protein  74.29 
 
 
245 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2872  hypothetical protein  53.05 
 
 
297 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0235  hypothetical protein  53.45 
 
 
273 aa  308  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  20.38 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  20.82 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  24.24 
 
 
2490 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1831  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  23.72 
 
 
370 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  23.94 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1184  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  21.97 
 
 
373 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  22.77 
 
 
258 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0957  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  23.53 
 
 
378 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  22.39 
 
 
216 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  20.9 
 
 
211 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>