28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4119 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4119  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  355  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2224  transport-associated  54.79 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0139  transport-associated  47.01 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4280  hypothetical protein  31.4 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3004  hypothetical protein  35.97 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000190621  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2208  hypothetical protein  35.25 
 
 		 157 aa  97.4  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334817  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1240  hypothetical protein  35.25 
 
 		 247 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000298594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0130  hypothetical protein  31.9 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2888  hypothetical protein  35.25 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000473114  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4952  putative signal peptide protein  35.76 
 
 		 197 aa  94  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102871  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0364  hypothetical protein  34.75 
 
 		 275 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000215357  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0399  hypothetical protein  34.53 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000314209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1549  hypothetical protein  34.53 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000180358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1737  hypothetical protein  34.75 
 
 		 275 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000645474  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  91.3  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215889  normal  0.294767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4744  hypothetical protein  30.49 
 
 		 178 aa  91.3  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.6988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5528  hypothetical protein  32.54 
 
 		 178 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5333  hypothetical protein  32.54 
 
 		 178 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3277  hypothetical protein  31.1 
 
 		 202 aa  90.9  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.0376988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4852  hypothetical protein  31.58 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4114  conserved hypothetical signal peptide protein  32.32 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.623928  normal  0.213496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4226  putative signal peptide protein  32.32 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02076  putative signal peptide protein  32.54 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5399  hypothetical protein  36.36 
 
 		 175 aa  84  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921981  normal  0.427129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4475  conserved hypothetical signal peptide protein  34.4 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0787  putative signal peptide protein  32.87 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00830  hypothetical protein  27.07 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.584767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  26.5 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>